密西西比麝香龟是典型的杂食性的龟，幼体偏肉食性，在捕食的过程中可以看出来其个性还是比较凶的，所以主人不要尝试用手拿食物挑逗龟，以免被龟咬伤，如果想增加互动性的话可以用筷子夹住食物。
密西西比麝香龟在自然界属于杂食性龟类，基本属于高度肉食性，主要进食动物蛋白，甚至连腐食也不放过。作为家庭饲养的宠物，食物来源除了安全卫生以外，还有一点就是获取必须方便。
人工饲养的情况下可以喂食优质龟粮、切碎去壳的新鲜鱼虾肉、添加维生素E的冰冻红赤虫、小蝌蚪、人工饲料蟋蟀、蜕完皮的面包虫和大麦虫幼体等等，相对来说，食用蜕皮的虫体更容易消化。对于幼龟，喂食红赤虫比较妥当。因为虫体柔软，便于小龟摄食，过硬的食物撕扯起来极易损坏龟苗稚嫩的指甲，断后长出的多是畸形指甲，鱼虾切碎去壳投喂也是出于保护指甲的需要。